Thunderbird и другие популярные браузеры уже долгое время изпользует sqlite в качестве хранилища сообщений
В среде Linux для ручного сжатия баз используем команду
find ~/ -iname "*.sqlite" -exec sqlite3 {} "VACUUM; REINDEX;" \;
В среде Windows рекомендую Speedyfox (Freeware). Можно запускать из командной строки
Системный администратор с 2000 года
Участник Freelancehunt, Хабр Q&A, cyberforum
Кейсы